EM菌被广泛运用于畜禽养殖业、水产养殖业、环境保护、医药行业及家庭日常生活等各个领域。
EM菌的机理与作用
一、在养殖业领域（一）能提高饲料有效养分的含量，氨基酸含量提高8%～28%，料肉（蛋）比下降15%左右。（二）能增强养殖对象的抵抗力，防止肠道感染，减少甚至不用抗生素类等药物。（三）能有效地去除畜禽粪便恶臭，改善环境，防止污染，节约饲养成本，加快畜禽和水产品的增重与繁殖，并生产出无污染的肉、蛋、奶、鱼等产品。
二、在环境保护领域（一）可去除污水中的污染物。（二）可控制水体藻型富营养化。（三）净化土壤，改善透水性，控制水土流失。（四）有效处理垃圾，使之再利用。（五）净化空气。
三、在医药行业领域能吞噬存在于医院环境和消毒液中的有害菌，使消毒液长期或一定时期内保持合格，使其不至于反复使用而造成对医疗用具、病房不同程度的再污染。
四、在家庭在家庭日常生活领域能抑制寄生在卧室、厨房、卫生间和室内空气中的多种细菌、病毒，减少疾病的传播和感染。
但市场购买的EM菌成本较高，1公斤在25元左右，但通过下面介绍的使用活力99增香增甜饲料发酵剂EM原液可节省成本近8-15倍！
活力99增香增甜饲料发酵剂（200克/包，市场售价仅需10元）由酵母菌、芽孢杆菌、乳酸菌等组成，通过下面的方法可以自制低成本、高品质的EM菌液，使用效果与市场上购买的基本一致。
在非金属容器中将本品1包（200克）与1公斤红糖（用甘蔗糖蜜代替效果更好）放入约50公斤温水中，简单密封48小时后就变成了加强型活性EM菌液（每毫升活菌在100亿左右）。
EM菌液使用方法如下
1.在畜禽上的使用方法：根据不同动物饲养周期按其饲料重量的0.1%-0.5%拌入饲料或饮水中后进行饲喂或饮用。
2.养殖场紧急除臭生物消毒：取加强型活性EM菌液兑水30倍清水，对产生臭味与异味的养殖区域、粪污水道、粪堆、污水池进行喷洒，以喷洒表面湿润为准，接待参观前1-3小时补喷一次效果更好。
3.制作青贮饲料：每吨青贮饲料中加入10公斤加强型活性EM菌液，简单喷洒在料上压实密封发酵15天以上。
4.养殖水产上的使用：每亩使用5公斤加强型活性EM菌液进行喷洒，晴天进行喷洒后注意增氧。
