据日本健康产业新闻报道，由于乳酸菌具有改善肠内菌群功效，乳酸菌市场一直保持着较高的需求量。其中灭活乳酸菌具有容易加工、品质稳定等特点，目前除了健康食品，普通食品也陆续采用灭活乳酸菌为原材料。特别是灭活乳酸菌的提高免疫效果备受关注，陆续开发着以抗过敏、抗疲劳、抗禽流感为目的的商品。

灭活乳酸菌功效相关研究历史悠久，目前被认可的功效有改善肠内细菌群、改善便秘、提高生体防御功能、提高免疫功能、抗过敏、美肤等等。其机理是通过调节信息传递物质来调节免疫系统、内分泌系统、神经系统功能来保持生体恒常性。

灭活乳酸菌与生菌乳酸菌相比品质稳定，生产中也可大幅度降低其他菌混入的风险，可添加到很多种类产品中，如青汁 、奶昔等健康食品，也可以添加面包、点心、面类、味增汤等普通食品中，以此可提高产品的附加值。灭活乳酸菌的另一个特点是与生菌乳酸菌相比，每克中所含乳酸菌数量显著增多，这也是很多生产企业关注灭活乳酸菌，采用灭活乳酸菌的原因之一。

最近也有企业研究将灭活乳酸菌应用到冷藏食品、日常食品中，这将会极速扩大灭活乳酸菌的应用范围。